Trong bộ phim ‘Free Willy’ thứ ba, Jesse (Jason James Richter) 16 tuổi và được làm việc trên một con tàu nghiên cứu cùng với người bạn cũ và người cố vấn của mình, Randolph (August Schellenberg). Sau khi Jesse gặp Max (Vincent Berry), Max không muốn cha mình đánh bắt và giết cá vôi nữa, cả hai cùng với nhà hải dương học Drew (Annie Corley) để ngăn chặn những kẻ săn cá voi trước khi chúng có thể đến được Willy và những người còn lại của anh ta. Pod, và thuyết phục họ từ bỏ hành vi tàn ác và bất hợp pháp của họ.